Et maratonløb blandt Europas bedste kræver en rute af international klasse, topservice undervejs og opbakning fra publikum ude på ruten. I 2007 og 2008 blev store dele af ruten til Copenhagen Marathon omlagt for at gøre den både mere løbevenlig og mere publikumsvenlig og denne rute holder vi fast i til Copenhagen Marathon 2009. Ruten går nu gennem de store hovedgader såsom Vesterbrogade, Nørrebrogade og Østerbrogade, hvor den tidligere har været henlagt til mindre sidegader. Ruten er stadigvæk afspærret og trafikfri og består af tre dele på hhv. 16, 10 og 16 km. Første og tredje del er næsten identisk, så løbere og publikum mødes flere gange under løbet. Ruten går gennem Københavns smukke gader og forbi byens mange seværdigheder.

Ret til ændringer forbeholdt. Ændringer bliver annonceret her på siden i god tid før løbet afvikles.